Sistem elektroforesis terdiri daripada dua komponen utama: Bekalan Kuasa dan Kebuk Elektroforesis. Bekalan kuasa membekalkan kuasa. "Kuasa," dalam kes ini, adalah elektrik. Elektrik yang datang dari bekalan kuasa mengalir, dalam satu arah, dari satu hujung ruang elektroforesis ke yang lain. Katod dan anod ruang adalah apa yang menarik zarah bercas bertentangan.
Di dalam ruang elektroforesis, terdapat dulang--lebih tepat lagi, dulang tuang. Dulang tuangan terdiri daripada bahagian berikut: plat kaca yang masuk ke bahagian bawah dulang tuang. Gel disimpan di dalam dulang tuang. "Sisir" kelihatan seperti namanya. Sikat diletakkan dalam slot di sisi dulang tuang. Ia dimasukkan ke dalam slot SEBELUM gel panas dan cair dituangkan. Selepas gel mengeras, sikat dikeluarkan. "Gigi" sikat meninggalkan lubang kecil dalam gel yang kita panggil "telaga." Telaga dibuat apabila gel yang panas dan cair menjadi pejal di sekeliling gigi sikat. Sikat ditarik keluar selepas gel telah disejukkan, meninggalkan telaga. Telaga menyediakan tempat untuk meletakkan zarah yang anda ingin uji. Seseorang mesti berhati-hati agar tidak mengganggu gel semasa memuatkan zarah. Memecahkan, atau memecahkan gel berkemungkinan akan menjejaskan keputusan anda.